Después de que el presidente de los estados unidos sea atacado por un mutante que se puede teletransportar, el gobierno decide hacerse cargo de los mutantes y le dan esta labor al general Stryker, un hombre sanguinario y con un claro odio hacia los dotados, además de formar parte importante del turbio pasado de Logan. Esta es la segunda entrega de la exitosa saga de películas de acción de superhéroes. El equipo de Los X-Men deberá rescatar a los chicos de la escuela de mutantes después de que fueron secuestrados por el general Stryker para realizar experimentos con ellos y sacrificar a los chicos que no le sirvan de ayuda.